甲狀腺炎患者以自身免疫性最多，首選內分泌科進行治療，必要時可以在外科、風溼免疫、甲狀腺專科就診。

　　甲狀腺炎的臨床分類多樣，按病原學分類，可分為細菌性、病毒性、自身免疫性、輻射後、寄生蟲、結核性、梅毒和艾滋病感染等。在臨床上最常見的甲狀腺炎是慢性淋巴細胞性甲狀腺炎和亞急性肉芽腫性甲狀腺炎和無痛性甲狀腺炎；從病原學角度最常見的是自身免疫性甲狀腺炎。

　　大部分甲狀腺炎患者主要表現為一過性甲亢或者甲減，所以主要通過內分泌科治療。部分患者會伴隨全身性自身免疫疾病，或者甲狀腺症狀本身就是全身自身免疫疾病的一部分，也可以在風溼免疫科急診，輔助內分泌治療。還有部分患者甲狀腺腫塊明顯，或者有壓迫症狀，需要手術治療，也可以在頭頸外科或甲狀腺專科就診，輔助內分泌治療。部分細菌性甲狀腺炎，感染症狀明顯，而甲狀腺功能正常，可以到外科就診、治療。

　　所以，甲狀腺炎是以甲狀腺炎症為共同特徵的一組疾病，其主要症狀一般是由甲亢和甲減引起，因此首選就診科室是內分泌科。