AC腦炎疫苗即AC流腦疫苗，其不良反應包括輕微的疫苗反應和特殊的疫苗反應。注射AC流腦疫苗主要是預防A群和C群的流行性腦脊髓炎，AC流腦疫苗接種後有非特異性的疫苗反應，包括注射部位的輕微疼痛、局部充血等表現，一般在注射疫苗後3天內可以逐漸消失，程度較輕微。

少部分兒童在注射AC流腦疫苗後可能會出現發熱，一般不會超過38℃，持續24小時之內會消失，不伴有其他感染的表現，包括頭疼、嘔吐、咳嗽、抽風等。如果AC流腦疫苗接種後發生高熱，體溫超過38.5℃，發生抽搐或者肢體的異常運動等異常的神經系統，或者感染表現，要注意合併其他感染的跡象，包括在合併急性期感染時注射疫苗，或者發生特殊的疫苗嚴重不良反應，應及時去醫院複診，避免神經系統的嚴重併發症。