兒童病毒性腦炎通過積極治療後，經過初期進入恢復期，一般治療半年後可以有很大改善甚至痊癒，恢復期主要表現包括以下方面：

1、神智比較清楚，神志系統恢復比較好，神經系統症狀逐漸好轉，神經系統病理徵逐漸消失，可自行吃飯、自行上廁所、與人進行交流；

2、生命體徵，體溫逐漸恢復正常，體溫記錄情況與正常人體體溫波動情況相同；

3、沒有上述臨床表現，比如發燒、噁心、嘔吐、頭痛、暈厥等症狀一般都可消失，在1-2個月內完全恢復正常。重型患者需要1-6個月才能恢復，在6個月內可能會出現持續低燒、多汗、失眠、乏力、肢體癱瘓、失語、流涎、痴呆、吞嚥障礙、肢體不自主抖動，癲癇發作等。經過積極治療，大部分小兒都能夠恢復正常。如果6個月以上殘存症狀，屬於腦炎後遺症，後期還要進行綜合康復治療。