自身免疫性腦炎是出現了抗神經細胞表面的抗體，以及抗突觸蛋白的抗體而引起的腦炎。自身免疫性腦炎在婦女和兒童當中最常見，可以表現為邊緣葉腦炎。邊緣葉主要包括海馬、杏仁核、扣帶回，這些腦葉出現問題後最常見的表現就是精神症狀，如精神異常、癲癇、記憶力減退、性格改變等。進行腰穿檢查時，如果檢出NMDA抗體則比較支持是邊緣葉腦炎。

如果是青年女性患邊緣葉腦炎，尤其是14歲以下的女性出現相應的腦炎症狀，並且腦脊液檢查相應的抗體陽性，這時可能要重點篩查有沒有卵巢的畸胎瘤。因為這類患者畸胎瘤的發生率比較高，研究發現畸胎瘤和邊緣葉腦炎有比較密切的關係。此外，自身性免疫性腦炎可能也跟身體某些腫瘤的發生有關，比如老年人也會在腫瘤或者是單純皰疹病毒性腦炎之後繼發NMDA腦炎。這種情況可能要更多的去篩查身體的其它地方，有無之前未發現的腫瘤，針對腫瘤進行治療。