紅斑狼瘡是一種典型的自身免疫性結締組織病，發病原因比較複雜，與遺傳呈一定的相關性。已經發現有50多個基因位點與紅斑狼瘡發病有密切關係。有一部分患者有家族聚集傾向，其家庭中有一部分人也患有紅斑狼瘡，或者其他結締組織病，所以基因遺傳在紅斑狼瘡的發病中佔有很重要的地位。

但不是攜帶易感基因就一定會患紅斑狼瘡，後天因素也很重要，包括內分泌，特別是性激素，與紅斑狼瘡的發病有密切關係，環境、藥物等也與紅斑狼瘡的發病有關。所以紅斑狼瘡的發病與攜帶易感基因有關，但它為遺傳因素和後天環境因素兩者長期共同作用的結果，而不是遺傳病。