新生兒紅斑狼瘡的症狀主要表現為皮疹和心臟傳導阻滯的表現。

這是因為母體內的自身抗體會通過胎盤傳給胎兒而發生皮膚的損害，大多見於女性，出生後幾周的新生兒會發現。皮損主要表現為亞急性皮膚型紅斑狼瘡的症狀，比如環狀鱗屑性的紅斑，主要見於頭頸、眼眶周圍曝光部位，但是非曝光部位也可受累。心臟傳導阻滯可以表現為完全性或者不完全性，大部分是三度，並且是終身性的。患兒有時也會出現血小板減少、溶血性貧血、白細胞減少和肝炎等系統的症狀。患兒的皮損通常會在6個月內自自動的消失，皮損消退後不留疤痕。

患者的母親可以是系統性紅斑狼瘡患者，也可以是其他風溼病的患者，多數的臨床上並沒有症狀。所以具有系統性紅斑狼瘡的妊娠的女性要定期的嚴密觀察胎兒的心臟變化，定期做心臟的彩超，這樣能及早的發現新生兒紅斑狼瘡。