小兒心肌炎經過正確合理的治療和充分的休息，絕大部分孩子是可以治癒的。部分孩子病情反覆，可能會留下後遺症，具體如下：

1、運動後乏力、胸悶、憋氣等症狀，遷延1年以上，會進入慢性期，慢性期的孩子會出現慢性心功能不全，年數久了以後會出現擴張性心肌病，最終死於心力衰竭；

2、有些孩子會出現各種心律失常，比如房性早搏、室性早搏、室性心動過速、房性心動過速；也可能出現各種傳導阻滯，一度阻滯心率是沒有問題的，二度、三度傳導阻滯時，心跳會有漏搏、有停頓，三度房室傳導阻滯最嚴重，心率很慢，心率只有40-50次，這時腦供血不足，會造成嚴重的缺氧，孩子經常會出現暈厥、甚至猝死。所以對於心肌炎的孩子，要定期進行觀察、隨訪、定期檢查。