支原體肺炎並不嚴重，嚴重的是合併肺外感染，比如心功能衰竭、呼吸功能衰竭、泌尿系統損害、中樞神經系統損傷，這部分患兒會比較嚴重。普通支原體肺炎經過儘早診斷、合理用藥後可以早期恢復，避免發生嚴重併發症。

患兒出現反覆高熱不退或者刺激性咳嗽，但肺部又沒有囉音，這部分患兒要找呼吸科醫生進行判斷，必要時住院治療，如可以做呼吸道病學檢查、咽拭子、呼吸道病原學檢查來檢測有無明確支原體感染。如果有明確支原體感染，合理治療後可以很快康復。