有些小孩表現很不典型，有時以發燒起病，有時以刺激性乾咳起病。另外，還有少部分患者不是以呼吸道症狀起病，而是以肺外症狀起病，比如心血管疾病、中樞神經系統疾病，腎臟疾病起病的支原體感染也不少見。

呼吸道支原體感染往往表現為高熱不退，多見於年長兒，早期主要表現為咳嗽、發熱、刺激性乾咳，臨床症狀很重，但是肺部體徵很輕、沒有囉音，但是胸部X線改變又很典型、很嚴重，所以支原體感染的特點是體徵和症狀、X線檢查不符。這部分患兒要到醫院做檢查，由呼吸科醫生做出檢查後明確診斷，可以選擇阿奇黴素或者紅黴素進行正規、足療程治療，才能痊癒，儘早診斷、合理治療可以避免併發症發生。