橋本甲狀腺炎是常見的自身免疫性甲狀腺疾病，其臨床表現多樣、進程各異，導致甲狀腺功能改變、甲狀腺腫大和甲狀腺結節。即使甲狀腺功能正常的患者也有諸多臨床症狀，易發生腫瘤及其它自身免疫性疾病，同時影響女性生殖健康。本病目前尚無法根治，主要是對症處理和阻止病情進展。由於患者的病情程度不同，症狀複雜多變，必須針對每一個患者的具體情況，從甲狀腺功能、甲狀腺腫、甲狀腺結節及伴發疾病、妊娠期和產後等不同方面進行精準治療。約5％的患者是甲亢，20％的患者是甲減，大多數甲狀腺功能可正常，大多數患者不需要藥物治療，少數亞臨床甲亢或甲減，但是隨著病情的發展最終的結局都是甲減。
左甲狀腺素的治療可以明確改善甲狀腺軸功能，降低甲狀腺相關抗體的水平，改善臨床症狀，所以要定期檢查甲狀腺功能，將促甲狀腺激素控制在參考範圍內。長期甲狀腺腫大最終會形成結節，必須定期判斷其良惡性。橋本甲狀腺炎易併發其它自身免疫性疾病，也需要根據情況對症處理。橋本甲狀腺炎會影響妊娠結局，除導致不孕、不育、流產，還可導致後代智力發育受損，需要及時監測和及時干預，才能保證母嬰的安全。