系統性紅斑狼瘡的病因目前不清楚，但可由多方面因素引起，包括內在因素和外在因素的綜合作用，具體如下：

1、遺傳因素：與遺傳有一定關係，但系統性紅斑狼瘡並不是遺傳病，而是與遺傳相關基因有關，為多基因相關疾病；

2、外界環境因素：如紫外線照射，與系統性紅斑狼瘡發病率有一定相關性。此外，與環境汙染、接觸化學試劑也相關，如染髮、甲醛等，有一定相關性；

3、藥物因素：使用抗結核藥等可導致系統性紅斑狼瘡發生；

4、激素因素：尤其與雌激素水平密切相關，故系統性紅斑狼瘡多見於生育期女性。