真菌性敗血症首先要明確一點，它並不是一種傳染病，是一種感染性疾病，是由真菌感染所導致。敗血症是一種感染性疾病，由於感染病原微生物不同，可以是細菌感染引起，病毒感染引起，也可以是真菌感染引起。真菌性敗血症臨床上一般是一種繼發性改變，比較少見，多見於免疫低下或機體狀態不太好的情況下，會發生真性菌敗血症。對於真菌性敗血症的產生一般有基礎疾病，常見引起真菌性敗血症的病原一般是假絲酵母菌或隱球菌、麴黴菌等，兒童真菌性敗血症最常見的是假絲酵母菌所引起。

在正常情況下，假絲酵母菌在自然界就可以存在，甚至在皮膚、口腔等可以有假絲酵母菌存在。對於機體免疫力正常或功能屏障完整的兒童，一般不會出現真菌感染，一般是在機體抵抗力比較低下、由於長期不合理應用抗生素、糖皮質激素或免疫抑制劑等情況下，如果出現皮膚黏膜完整性損傷，或出現屏障結構損傷，或由於吸入含有真菌孢子的空氣時，可能引起真菌感染，甚至進行血行播散而出現真菌性敗血症。