絕大多數病毒性腦炎不能自愈，但臨床中也有部分的病毒性腦炎患者可以自愈。常見的病毒性腦炎種類有單純皰疹病毒性腦炎、帶狀皰疹病毒性腦炎以及腸道病毒性腦炎等。

單純皰疹病毒性腦炎是比較嚴重的類型，發病後患者可迅速出現發熱、頭痛的症狀，如治療不及時，症狀會很快進展，病人出現意識障礙、癲癇抽搐等，最後因廣泛的腦壞死和腦水腫而死亡。

腸道病毒性腦炎多於夏季發病，輕症者表現為發熱、頭痛，少數重症者可有癲癇和意識不清症狀，多數患者病後2-3周可自然緩解，屬於可自愈的病毒性腦炎。