肝上有囊腫可以做B超或CT平掃檢查，以明確囊腫大小、部位。

小囊腫無需處理或囊腫位於不重要的部位不必急於處理；如囊腫發生在重要的部位，如靠近下腔靜脈或者靠近膽管部位，並且生長非常迅速，對於此類囊腫的處理方法為在腹腔鏡下做小囊腫開窗，把中間的水全部吸乾淨，把中間的囊壁全部敞開以後流出囊液會通過腹腔、腹膜再吸收，囊腫不會再出現。

如果囊腫發生在不重要的部位，大可不必過於擔心，因為有些囊腫完全可以不引起任何症狀。