肝囊腫手術一般取名叫去頂術，把肝囊腫頂去掉，讓囊液引流到腹腔裡面，達到不再繼續長大的目的，所以手術很簡單，一般都是微創手術。腹腔鏡打3個洞，2個5mm的洞，1個10mm的洞，這樣把頂去掉，把囊液吸掉，讓囊液引流到腹腔裡面，手術半個小時就結束。

但是有部分病人肝囊腫位置在膈頂，緊貼膈肌，手術以後很容易用膈肌把開窗孔封起來。這種情況為防止術後引流不暢，或者所謂的術後復發，可以做帶蒂大網膜瓣填塞，取一段大網膜帶血管蒂塞到囊腔裡面，以後產生囊液可以順著大網膜流到腹腔，減少復發的機會。所以手術可能時間較長，可能需要將近1個小時。