在綜合性醫院，肝腹水患者應該掛肝臟內科，如果沒有肝臟內科，可以掛消化內科。另外，肝腹水可能由於外科原因導致，如肝癌患者也可以掛肝膽外科，最好的選擇是掛肝膽內科或肝臟內科。部分綜合性醫院相關科室稱為感染科或肝病內科。

若到傳染病專科醫院就診，則每個科室都可以看肝腹水，雖然稱為傳染病醫院，但目前主要治療的病種是肝病。肝腹水原因，包括病毒性肝炎、酒精性肝病引起的肝腹水，以及藥性肝炎長期反覆發作，也可以引起肝硬化腹水，都需到專科進行就診。