髓母細胞瘤常見檢查方法為頭顱CT、頭顱核磁共振，髓母細胞瘤在頭顱CT、磁共振上會發現在後顱窩、小腦蚓部或者第四腦室佔位，佔位應在CT上表現，多數都是低密度、相對邊界。因為長在第四腦室，有時少部分會出現鈣化，屬於髓母細胞瘤的直接徵象。

間接徵象會堵腦脊液循環通路，造成幕上腦積水、幕上腦室擴大，磁共振方面表現是T1上低信號，然後T2是稍高信號的類圓形佔位，有明顯強化。