雙腎囊腫不嚴重，腎囊腫常由於腎小管稀釋引起，當出現稀釋外口梗阻時會導致稀釋明顯變大，出現>2cm左右的囊性結節。通常腎臟雙側出現多個小囊腫，小囊腫通常對腎功能沒有影響，也不影響排尿功能，所以腎囊腫通常不嚴重。

隨著囊腫逐漸長大，最大的囊腫可以達到5-7cm，甚至10cm左右，此時會出現腎包膜局部牽拉，引起腎臟脹痛或墜痛的症狀。囊腫還會壓迫腎實質，影響腎小球功能，此時需要進行腎囊腫開窗手術治療。對於年齡較大的患者，也可以採取保守治療，通過B超的引導，穿刺吸取囊液，再局部注射硬化劑，也可治療單純性腎囊腫。雙側腎囊腫與單側腎囊腫的患者治療方法相同，常選擇保守治療，當囊腫>5-7cm時，建議進行腹腔鏡腎囊腫開窗手術治療。