多數腎囊腫沒有症狀，腎囊腫屬於常見疾病，在中老年人群中發病率較高，可在體檢時發現腎上囊腫。腎囊腫一般沒有明顯感覺，除非生長迅速，多數囊腫甚至實性腫瘤，生長都是比較緩慢的過程，如1年增長1cm。腎臟對於快速膨脹、牽張感覺比較明顯，但是對於1年長1cm，非常緩慢的持續牽張過程，反應非常不敏感。

緩慢生長的腎囊腫沒有症狀，部分患者出現腰疼、腰部不適、酸脹等，多數與囊腫沒有直接關係，可能與腰椎或者腰部肌肉勞損等疾病相關。多數患者體檢發現有腎臟囊腫後才覺得腰部不舒服，主觀上把其他疾病與症狀強行牽連在一起，只有非常罕見的病例中，如囊腫合併出血、感染，此時患者可能會有腰痛、發熱等感染相關症狀。