肛周膿腫是細菌感染引起的化膿性炎症，早期應該以應用抗生素治療，口服或者輸注抗生素。比較嚴重時可以通過手術切開引流之後，膿液引流乾淨後可以應用去腐生肌膏以及消炎軟膏等。

這些藥物可以加速肛周膿腫的組織吸收，促進早期癒合，對於肛周膿腫的患者比較有益。對於有些肛周膿腫形成了較大的膿腔，或者發熱，膿腫持續擴大，這種情況暫時不適合應用外用的藥膏，可以通過手術切開引流之後，應用去腐生肌膏以及消炎軟膏等。