肛周膿腫患者採取保守治療，只有當局部肛周膿腫的紅、腫、熱、痛基本消失，在彩超影像學上看到了肛門周圍的低迴聲區域明顯得到改善，基本達到了痊癒的程度。臨床當中肛周膿腫保守治療的效果一般，並不是特別理想，因為保守過程當中也有可能會出現反覆復發或者併發肛瘻。

因此肛周膿腫原則上診斷明確以後儘量採取手術治療的方案，通過手術切開引流，術後定期更換切口敷料，能夠有效的使肛周膿腫基底部的壞死組織充分引流體外，有利於肛周膿腫術後的恢復，最終癒合以後復發的幾率就會大大降低。