肛周膿腫即便做了根治術後，還是存在著復發的風險，這是由於疾病的發病特點決定的。肛周膿腫的發病大部分都是因為腺源性感染，肛門齒線以上存在原發性的內口，導致肛周脂肪組織的化膿、感染，局部的膿液越聚越多，壓力比較大就會產生劇烈的疼痛。肛周膿腫根治術就是在切開引流的基礎上的進一步擴大切開膿腔，儘量找到原發性的內口，把內口切除，對於疾病的治療比較徹底。

但是即便這樣，因為肛周膿腫的化膿期內口不太穩定，醫生只是根據經驗來尋找內口，但不一定是準確的內口，所以還是存在著復發的風險，另外肛門周圍的其他地方也可能出現肛周膿腫這種疾病。