小孩肛周膿腫，隨著自身免疫力的增高，以及母乳餵養，在炎症早期又得到有效的控制，自行用藥物保守治療，膿腫消退後，有可能後期不再發生。

隨著年齡增加，雄性激素水平下降，肛竇活動漸漸變少，外加大便順暢，有可能再也不發生肛周膿腫或者肛瘻。但現在研究發現有少部分患兒，隨著身體長大，免疫力慢慢增強，有可能治癒，不再發作。