在臨床上，肛周膿腫手術需要一個小時左右的時間，而且，一旦患者診斷為肛周膿腫，最好及時行切開引流術，因為膿腫切開引流是治療肛周膿腫的主要方法，手術方式因為患者的肛周膿腫部位不同而有所差異。通常，如果患者的肛周膿腫比較淺表，可以在局麻下進行切開引流，在波動最明顯的地方與肛門呈放射狀的切口切開，沒有必要進行填塞就可以保持患者的引流通暢。

另外，如果患者的肛周膿腫比較深，這時候必須要引流通暢，可以選用放置油紗布進行引流，而且術後要給予患者止痛、換藥等處理，並且要積極保持好患者的引流通暢，這樣患者才能恢復良好。