子宮內膜增生紊亂，先要明確診斷，查明患者是否患有多囊卵巢綜合徵、卵巢腫瘤或者內分泌功能異常等，再採取藥物或者手術做針對性治療。此病症的臨床表現為子宮不規則出血，對於年輕未育的患者可以採取藥物治療，如服用促排卵藥物、孕激素類藥物，後者可以抑制雌激素所引起的子宮內膜增生紊亂。

但對於藥物治療無效者，可進行手術治療，如經宮腔鏡進行微波、紅外線、激光或者內膜剝除術，絕經期婦女建議做子宮全切術。應根據患者的年齡、子宮內膜增生類型做相應治療。