患者肛周膿腫3cm是否嚴重，需要根據以下情況進行判斷：

1、高位膿腫：若肛周膿腫侵犯到距離肛門口以上3cm高度的肛門括約肌，則屬於高位膿腫，情況較為嚴重。患者在治療上需考慮是否進行掛線治療，但也需根據患者肛門括約肌的高度而定。儘管每位患者括約肌高度均在一定的正常範圍，但也有所差異，而且前方括約肌較短而後方括約肌較長，若侵犯到前方括約肌3cm位置則確實屬於較高區域，患者需要謹慎治療。若為女性患者則可能更為嚴重，因為女性括約肌可能相對更短；

2、普通膿腫：若為膿腔深度3cm而不涉及括約肌則並不嚴重，治療方式也較為簡單。

因此，肛周膿腫的嚴重程度與處理方式，主要在於括約肌被侵犯的高度和所侵犯的位置，後方括約肌3cm相對而言較輕，而前方括約肌較為嚴重。治療方面根據部位不同，具體情況也有所不同。