肛周膿腫是由肛旁腺炎症引起，炎症逐漸加重後會在局部形成膿液積聚，從而形成肛周膿腫。肛旁腺存在炎症時，炎症刺激可導致周圍組織水腫，神經末梢受到刺激後，會出現肛周疼痛症狀。所以肛周膿腫通常會先出現疼痛，繼而會在肛周摸到皮膚較腫、硬，或有包塊，此時肛周腫塊會出現壓痛，還有皮膚髮紅、皮溫升高的表現。

肛周膿腫分為淺部膿腫，以及坐骨直腸窩膿腫、骨盆直腸間隙膿腫等深部膿腫。肛周淺部膿腫包塊較明顯，如果是骨盆直腸間隙膿腫或坐骨直腸窩膿腫，由於膿腫位置較深在，肛周可能只是出現疼痛或發熱症狀，沒有明顯的肛周腫塊。多數肛周膿腫是以先出現疼痛為主，肛周皮下膿腫可出現破潰，破潰後出現流膿現象，此時可能形成肛瘻，通常不會自愈，需要進行手術治療。