肛周膿腫可以用紅黴素軟膏，但是治療效果較小，一旦出現肛周膿腫，需要選擇手術治療，藥物治療療效有限，外用的抗生素效果有限，即使輸液、口服抗生素，對於肛周膿腫療效也有限。

肛周膿腫一旦形成，手術治療效果立竿見影，手術切開，膿腫放出來，進行一段時間的引流，膿腫就逐漸緩解。膿腫破潰，膿已經流出，建議患者還需要到醫院進行切開引流，自行破潰的破口太小，引流不夠充分，肛周膿腫的治療原則要充分引流。