肛周膿腫是較小的手術，手術完以後不需要住太多時間，大醫院床位較緊張，肛周膿腫手術後，3天左右就可以出院。因為肛周膿腫手術以後，前1-2天要在醫院裡換藥，用油紗布填塞，主要是防止出血，3天以後出血不會發生，這時可以回家，到門診換藥或者回家自己換藥。

如果肛周膿腫是在較小的醫院做手術，床位不是太緊張，可能住院時間比較長，但在三甲醫院不會留太長時間，最多可以住3天，沒有出血、滲出以及其他特別危險，大部分都可以出院回家，去門診或者自行換藥。肛周膿腫術後傷口完全癒合可能需要很長時間，有的可能需要2-3周，有的甚至要1個月左右，不需在院裡住太長時間，門診就可以換藥。