肛周膿腫應根據患者具體情況，選擇合適的治療方案。肛周膿腫主要是針對致病菌，使用有效的抗生素治療。臨床的抗菌藥物包括青黴素、卡那黴素、頭孢類藥物等，可以聯合消炎止痛、外敷膏藥等輔助治療。此外可使用高錳酸鉀溫水坐浴。若出現膿腫破潰，可使用溫鹽水或甲硝唑水沖洗。膿腫經保守治療無效後可行手術治療，將膿腫切開引流或掛線治療。

早期肛周膿腫可在肛門周圍出現小硬塊或腫塊，常伴有疼痛。若不進行治療可導致疼痛加劇，出現紅腫、發熱、墜脹不適感。肛周膿腫多由於肛腺感染，經內外括約肌皮下擴散形成，臨床可表現為肛周持續疼痛，受壓、咳嗽或排便時加重。局部可見肛門緣皮下紅腫伴硬結或觸痛，若未進行治療，後期可出現波動感。