肛周膿腫自行潰破後也能夠癒合，以後不再復發的病例很少，這和膿腫的表淺、患者後期保養是否得當都有關係。肛周膿腫自行破潰後再復發的病例是大多數，這是由於肛周膿腫的原發病灶得不到根治所致，肛周膿腫原發病灶部位是一個特殊結構，稱為肛竇，肛竇是開口向上的竇狀結構，很容易存留糞便，肛竇內有肛腺，通向肛門周圍組織，肛腺屬於內分泌腺，一旦存留糞便就容易感染形成肛周膿腫。

因此，肛周膿腫破潰後，雖然膿腔內膿液能夠排出來，但肛竇內感染病灶難以去除，也就是原發病灶不能根除。這就是為什麼肛周膿腫自行破潰後雖然癒合，還會復發的原因，需要採取措施，根除原發病灶，才能夠根除疾病。