肛周膿腫可分為很多種，包括皮下膿腫、坐骨直腸窩膿腫、直腸周圍膿腫、直腸後間隙的膿腫。如果是皮下膿腫，切開引流或者做肛周膿腫一次性根治手術，患者可能一週後能夠完全痊癒。

但是坐骨直腸後間隙或者骨盆直腸間隙膿腫，切開引流以後會形成高位、複雜肛瘻。而高位、複雜肛瘻形成以後如果不做肛瘻手術，肛周膿腫會反覆發作，很難能夠癒合。做完高位、複雜肛瘻的手術以後，癒合時間根據範圍和深度也是有很大差異。一般坐骨直腸窩膿腫形成高位肛瘻大概有可能癒合，時間在35-40天。如果是更高範圍的、更大的膿腫，患者可能需要6-12個月癒合。