肛周膿腫做完手術後，對於較淺、較小、病情較簡單的肛周膿腫，癒合時間比較短，一般2-3周可以完全長平、癒合，但是對於位置比較深，涉及肌間隙較多的膿腫，腔也較大，這種情況組織修復比較困難，時間相對也長，尤其是掛線、放引流管，此類情況癒合時間可到1-2個月，甚至2-3個月，尤其合併有特殊疾病，比如糖尿病、結核或合併有其它免疫功能低下的患者，癒合時間也會相應延長。

另外，部分老年人本身營養功能不好，營養比較差，癒合時間也比較長，有時幾個月甚至半年到一年，所以綜合以上因素，肛周膿腫手術治療以後恢復時間並不會固定，要根據患者自身情況以及治療情況做出正確判斷。