多數矮小症兒童通過正規的治療可以獲得滿意療效，關鍵是要早期診斷，正規治療。首先要明確兒童矮小的原因，針對病因採取相應的規範治療方法。首先正確診斷才有治療，治療前需要完善相關檢查、明確診斷，充分告知家長治療的益處與風險。並非所有矮身材都需要治療或能治療，比如體質、青春發育延遲、軟骨發育不良等情況。

應當針對不同病因給予不同治療，如生長激素缺乏症患兒，可使用重組人生長激素治療；甲狀腺功能減低症的患兒口服左旋甲狀腺素片治療；營養素缺乏的患兒通過改善營養後一般會生長加速。

其實大多數孩子個子矮小，並不能找到明確的致病原因，這種情況稱為特發性矮小。對於特發性矮小也可以給予重組人生長激素治療，一般都會收到很好的療效。