無精症手術包括睪丸活檢和睪丸顯微取精，睪丸活檢可直接在門診進行，手術較簡單，一般10-20分鐘即可完成，患者無需住院。睪丸顯微取精手術，患者需全麻，進行術前準備，一般需住院3-4天左右。雖然睪丸顯微取精手術較小，但屬於正規手術，所以必須住院治療。術後會根據患者病情進行監護，使患者達到康復出院目的。

梗阻性的無精子症會根據患者的情況做輸精管和附睪的吻合術，屬於輸精管道重建手術，也需住院進行。部分患者患有較重度的精索靜脈曲張，也需住院進行手術治療，部分患者通過手術可獲得少量精子。