結核性腹膜炎與肺結核治療基本上一樣，都需要藥物抗結核。如果合併腹水，根據腹水量多少進行治療。如果為少量腹水，可以通過抗結核自行吸收。

如果腹水量較多，為了緩解症狀，減少腹腔粘連，可採取腹腔穿刺抽液，把腹水抽出來也是最主要治療手段之一，可以減輕病人結核中毒症狀。腹水中含有大量纖維條索，抽出腹水之後減少腹腔粘連，可提高臨床療效、減少併發症，更有利於疾病恢復。