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胃炎的治療需根據具體情況而定，部分患者症狀較輕，但在胃鏡下可發現潰瘍、息肉，而部分患者症狀較重，胃鏡下表現較輕微，但症狀遷延不愈、反覆發作。醫生需要根據患者的內鏡表現及患者症狀制定治療方案，採用個性化治療。若內鏡下發現患者存在胃息肉等明顯的器質性因素，可以由醫生判定是否需要進行內鏡下治療。
膽汁反流是否屬於功能性胃腸病，需明確是否存在器質性原因造成病理性膽汁反流。在進行部分胃大部切除術、胃空腸吻合術及膽道手術後，患者會由於幽門切除或膽道結構發生變化而導致膽汁易反流到 胃內。若由於炎症導致膽汁及胃酸刺激十二指腸造成逆蠕動，也會使幽門功能減弱、關閉不全，從而造成膽汁反流。
治療慢性胃炎常用的中成藥包括摩羅丹、胃復春、枳術寬中、附子理中、參苓白朮、養胃顆粒等，品種繁多、琳琅滿目，但比較重要的是日常生活中要養護好。此外中成藥的選擇，要根據自身身體寒熱，及疾病程度進行選擇，重要的是需診斷清楚、檢 查清楚。
急性胃腸炎初愈時，進食的整體原則是食用容易消化、吸收的食物，儘量避免生冷、刺激性的食物。因為患者剛患急性胃腸炎時，整個消化功能會受到影響，所以飲食以清淡為主，應該適當、逐步增加營養食物。
糜爛性胃炎通常服藥時間是6-8周，是基本的治療時間。經過一段時間的治療以後，多數患者的糜爛可以得到癒合，但糜爛性胃炎通常在慢性胃炎的基礎上發生。慢性胃炎的複發率較高，影響到復發的因素也較多，包括情緒、環境、飲食的影響，均可引起胃炎復發。所以有時治療6-8周後，根據患者的具體情況分析，可能還會適當用藥物進行鞏固維持治療。
腸胃炎沒有藥可以自行緩解，較多腸胃炎不需要用藥就可以自行緩解。關鍵是疼痛頻次是否減少，腹瀉是否一天不超過3次，喝米粥等可自行恢復。此外可以按摩穴位，肚臍兩側的天樞穴，腿上的上巨虛、下巨虛，肚臍上的中脘穴，都可以緩解腸胃炎的症狀。尤其天樞穴比較重要，而且比較容易找 到。
腸胃炎吃益生菌有用，可以幫助恢復。部分腸胃炎是腸道群失調導致，但補充益生菌也有限度，不是越多越好。如果病程較久，或由於其他疾病，胃腸菌群失調較嚴重，可以在醫生指導下補充益生菌。但也要通過補充益生菌，恢復自身益生菌，自己產生比較重要。
一般麥滋林治療胃炎有效，該藥屬於胃黏膜保護劑類型之一。但胃炎形成原因較為複雜，黏膜保護劑雖然有效，但不一定能完全解決胃炎相關問題。患者需排查幽門螺桿菌感染，存在幽門螺桿菌感染時則屬於活動性胃炎，但患者不一定有症狀。
膽汁反流性胃炎的治癒時間因人而異，大部分患者經過6-8周的治療，病情即可得到較好的控制。但也有部分患者治療1-3年後，病情也沒有得到有效控制。膽汁反流說明幽門機能出現問題，胃和十二指腸的接口稱為幽門，是單向出口，故食物從胃中進入小腸後不可再返回到胃中。
急性胃腸炎患者如果伴有發熱，大多數是感染性腹瀉，首先需進行抗感染治療。在抗感染基礎上，如果還有發熱情況出現，其次需退熱治療，一般如果體溫在38.5℃以下，沒有明顯頭痛、全身乏力症狀出現，對症治療即可，比如補液、多進食、多飲水，也可以物理降溫，比如溫水 擦浴等。