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肛門鏡可以查出直腸炎，但是肛門鏡的長度有限，在臨床檢查的時候用肛門鏡檢查，只能看到直腸下段的黏膜，臨床表現是下段黏膜充血、水腫或者有糜爛出血點、潰瘍點，甚至在肛門鏡底部可以看到黏液血，但是肛門鏡檢查不能完全看到直腸的全段。
直腸炎患者可以吃益生菌，直腸炎會出現大便次數增多、腹瀉，腹瀉期間腸道黏膜受到損傷，腸道內有害菌與有益菌比例會出現失調或者腸道內菌群失調，也會導致直腸炎引起腹瀉。因此，直腸炎患者可以吃益生菌，包括雙歧桿菌乳桿菌三聯活菌片等。
醫生說直腸炎不用吃藥，一般針對部分病情尚不嚴重的患者，他們一般無全身症狀，未伴明顯黏液血便、腹痛、出血、腹瀉或便秘等症狀，經過一般處理即可好轉，暫時不用吃藥，而其他患者依然需要進行藥物治療。
直腸炎患者積極進行治療是可以治癒的，但可能會由於日常飲食習慣不良、感染、過度勞累等因素復發，因此無法根除。直腸炎可根據發病原因的不同，分為潰瘍性直腸炎、感染性直腸炎、放射性直腸炎等多種類型，但可有直腸出血、直腸疼痛、腹瀉、黏液膿血便等共同表現。由於類型較多，可從以下幾種方法進行治療：
直腸炎的種類較多，並不是所有的直腸炎都需要用美沙拉秦栓治療，美沙拉秦栓能治療直腸炎中的輕度或中度潰瘍性直腸炎。美沙拉秦常被視為輕、中度潰瘍性直腸炎和克羅恩病的首選用藥，它的劑型包括片劑和栓劑，如果潰瘍性直腸炎和克羅恩病的發病部位位於直腸或乙狀結腸，那麼就可以用美沙拉秦栓對兩者進行治療。
雖然肛門墜脹、墜痛、排便不盡可見於多種疾病，但臨床仍以直腸炎、肛竇炎最為多見，直腸炎常有肛門墜脹（或脹痛、墜痛）、排便不盡、不暢或不爽的表現及腹部隱痛、墜痛等表現，病因不明，反覆發作。鏡檢特點：急性期常表現粘膜腫脹、肥厚，表面呈粗糙顆粒，可有糜爛，伴有粘液，慢性直腸炎可見粘膜乾燥、色灰白，粘膜下可見血管網，肛竇炎的臨床表現類似，肛門鏡下可見肛竇充血及分泌物，可有壓痛。在排除器質性病變的情況下我們可以針對治療：
直腸炎如果不積極的治療，可造成病情惡化，腸道嚴重受損，抵抗力減小，不排除繼續惡化到癌變的程度。其與患者的年齡、病程、病變範圍、組織學特徵、病變活動度、臨床表現等多方面有關，不可一概而論。