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肝臟有陰影提示可能存在肝臟佔位性病變，包括肝臟良性疾病和惡性疾病。肝臟良性疾病主要包括肝囊腫、肝血管瘤、脂肪肝、肝硬化等，此類疾病陰影邊緣通常比較光滑、清楚，以及包膜完整。肝臟惡性疾病主要是指肝癌，病情變化相對進展迅速，預後較差。
一旦出現小的肝囊腫，基本上不會自行消失，只不過每個人增長速度不同，若一直都表現為小囊腫，終生無需治療。若肝囊腫生長較迅速或體積長到很大，有可能壓迫周圍器官，需對肝囊腫進行治療，常見肝囊腫的治療方式是腹腔鏡下的囊腫開窗手術。
多發性肝囊腫是一種良性病變，一般會合並其他器官囊腫，如腎臟囊腫，稱為多囊腎。囊腫一般都是先天存在，囊腫的界較清晰，囊腫內儲存的囊液一般不會在臨床上發現，在體檢做超聲時偶然發現。囊腫可分佈在肝臟各個肝段，也可侷限在膽道內。囊腫 液體隨著囊腫類型、大小、併發症等發生改變，絕大多數情況下，多囊肝囊液是澄清的。
肝囊腫做穿刺與介入是不同的概念，做穿刺只為把肝囊腫裡的東西取出，介入治療難度相對比較高，即把肝囊腫治療好，因此這是兩個相對不同的概念。囊腫就是平時所說的水泡，水泡內液體，在超聲引導下穿刺針進到囊腫將裡面的液體 抽出，抽出後把囊腫內的液體送去化驗室或病理科進行化驗，便完成穿刺的目的。若臨床醫生認為囊腫可能與診斷有關，或裡面有寄生蟲、細菌、病毒感染，可只進行穿刺。後期檢驗科與病理科醫生明確診斷後，便可進行對應治療。
做完肝囊腫介入手術後大部分情況均要絕對臥床休息，若為重要臟器在病房還需上心電監護進行實時監護，若有不舒服，如肚子痛、噁心、嘔吐、眩暈，或穿刺部位感覺有東西流出，穿刺部位逐漸增大，都要及時告知醫生。肝囊 腫介入手術有特殊性，肝臟血供非常豐富，因此肝臟做完穿刺後肯定會有出血，少量出血會自凝，只需術前評估好風險與凝血功能即可。
肝囊腫介入治療後有復發風險，但復發幾率不高。肝囊腫介入治療復發的機理跟操作過程、操作方法有關。超聲引導下的肝囊腫穿刺硬化治療與外科手術治療機理截然不同，外科手術治療是將整個肝囊腫全部挖掉，超聲引導下是進行穿刺把囊腫裡 的液體拿掉，但液體外面的囊壁還存在，就相當於氣球把內的氣體放掉後，氣球仍存在，因此有可能造成復發。
肝臟囊腫是臨床常見囊腫之一，是一種先天性肝臟良性病變，一般肝臟小囊腫無任何症狀，不需要特殊處理。生長速度較為緩慢，一般沒有發生惡性病變可能，無需處理。無論生活、飲食或運動和正常人一樣，建議平時避免進食油膩濃稠食物，避免喝烈酒，避免食用辛 辣油炸食品，飲食以低脂肪、低熱量、富含纖維素為主，1-2年檢查一次超聲檢查即可。