急性上呼吸道的感染是鼻腔、咽或喉部急性炎症的概稱，常見的病原體為病毒，少數是細菌。細菌感染可直接發生或繼發於病毒感染之後，首先以溶血性鏈球菌為多見，其次為流感嗜血桿菌、肺炎鏈球菌和葡萄球菌等。急性上呼吸道感染中的普通感冒、病毒性咽炎、喉炎、皰疹性咽峽炎、咽結膜熱，均是由病毒感染所導致，可以應用抗病毒藥物治療，如奧司他韋、利巴韋林等。
若沒有合併細菌感染，則不需要加用抗生素類藥物，其他可以使用的藥物主要是對症的解熱鎮痛以及緩解症狀。對於細菌性咽扁桃體炎，多是由於溶血性鏈球菌所引起，因此這個疾病可以使用抗生素進行治療，如阿莫西林、紅黴素、阿奇黴素、頭孢菌素。有一些上呼吸道感染，如果治療不及時，炎症可以波及其他器官，發生相應的症狀，引起鼻竇炎、中耳炎等，此時的治療應該需要使用抗生素進行抗炎治療。上呼吸道感染也容易向下發展，引起支氣管炎和肺炎，若出現細菌性支氣管炎及肺炎，也需要使用抗生素類藥物。