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病毒性腦炎為病毒侵犯神經細胞引起炎症、水腫、壞死等改變，多數屬於自限性疾病。病情輕重不等，輕者可自行緩解不會留下任何神經系統後遺症。少數病情危重患者，尤其單純皰疹病毒腦炎者，可以出現腦實質嚴重受損、預後較差，多數可遺留神經及精神異常，也可出現運動障礙、癲癇、視覺、聽覺功能受損及智力低下、反應遲鈍，易導致死亡或遺留嚴重後遺症。
病毒性腦炎患者出現頭痛的時間往往不超過1周。病毒性腦炎是由病毒感染引起，並且多種病毒均可引起，根據感染的病原體不同，患者的治療效果不同。如果患者不能及時對因治療，即原發病因不能得到及時控制，則頭痛的嚴重程度不會得到最終緩解。
腦炎發燒持續時間往往在1周左右。腦炎屬於中樞神經系統感染，通常是病原體進入人體後導致。導致腦炎的病原體較多，根據感染的不同病原體，腦炎可分為病毒性腦炎、細菌性腦炎、真菌性腦炎以及寄生蟲導致的腦炎。另外，由於感染的病原體不同，腦炎患者的發熱時 間也不同。
抗NMDAR腦炎是自身免疫性腦炎的一種，自身免疫性腦炎主要表現為精神行為異常、認知功能障礙、近事記憶力下降、癲癇發作、語言功能障礙、運動障礙、不自主運動、自主神經功能障礙以及不同程度的意識障礙等。輔助檢查腦脊液可見核細胞正常或增多，腦脊液自身免疫性腦炎相關抗體陽性，頭顱核磁共振可見邊緣系統有異常信號，腦電圖可能有癲癇樣放電，瀰漫性多灶性分佈的慢波節律。
乙型腦炎病毒是一種人畜共患的自然疫源性病毒，約有60種動物可感染乙腦病毒，是本病在自然界中的動物宿主，而豬是導致人感染最重要的傳染源。豬感染乙腦病毒3-5天可發生病毒血症，人被攜帶乙腦病毒的蚊子叮咬之後而導致感染。
單純皰疹病毒性腦炎是最常見的散發性、致命性腦炎，年發生率為1/50萬-1/25萬，無明顯季節性和性別差異，死亡率高達30%，且神經系統後遺症發生率高，因此比較嚴重。本病臨床表現和體徵無特異性，表現為頭痛、發熱、頸強直、局灶性神經功能缺損、意識障礙、精神行為異常、癲癇及認知障礙等。單純皰疹病毒性腦炎可能造成顳葉出血，為減少神經系統後遺症，應儘早進行診斷和治療。因此，當臨床考慮單純皰疹病毒性腦炎時，應立即開始治療，並根據腰穿結果、影像學、血清學和分子檢驗結果進行調整。
自身免疫性腦炎是一類由自身免疫機制介導的，針對中樞神經系統抗原產生免疫反應所導致的腦炎。本病核心症狀表現為亞急性起病的工作記憶障礙、精神行為改變以及精神症狀，認知和行為改變有時較早發生，更多的是伴隨睡眠障礙、癲癇 、活動障礙、小腦共濟失調或腦幹症狀。
2歲兒童一般囟門已經閉合，部分兒童囟門還沒有閉合，囟門突起是否有臨床意義，需要結合具體情況判斷。如果兒童各方面情況良好，只是哭鬧時前囟門隆起，屬於正常現象。如果安靜狀態下前囟門隆起且張 力高，提示顱內壓力增高，可見於顱內出血、腦積水、腦腫瘤及腦炎等疾病。
腦炎後遺症一般會在6個月時顯現，但不一定所有腦炎患者都會有後遺症。輕症腦炎一般不遺留後遺症，腦炎後遺症多發生在重症腦炎患者，此類患者神經影像學如頭部磁共振等檢查可見結構性異常，如腦軟化、膠質增生等。