口腔病理由外科醫生切取一塊組織，送至病理科，病理科通過組織取材，即把組織切成小塊，經過組織脫水處理後進行組織包埋。

組織包埋是將組織通過石蠟固定，變成一個硬的組織，便於進行組織切片。組織切片是將其切成4μm左右的薄片，組織切片後進行組織染色。

通常所用染色方式是蘇木素-伊紅染色，即區域染色，把細胞胞核染成藍色，細胞包漿染成紅色，此時可在鏡下分辨不同的組織細胞和形態，根據此情況可做不同的切片診斷。

切片可在顯微鏡觀察下進行診斷，顯微鏡目鏡通常有4倍、10倍、20倍和40倍等類型。