絲狀角膜炎形成的病因較為複雜，發病機理尚未明確，主要由於病毒感染或者免疫力異常，同時見於眼表的部分疾病，如角膜移植術後的乾眼，乾眼包括有乾燥性綜合徵、Siogren綜合徵這類疾病。絲狀角膜炎病理生理的主要變化，包括上角膜上皮細胞異常增殖及角膜上皮細胞與前彈力層，即上皮細胞分泌均質膜的黏合力不足，還包括黏液形成過多。

在臨床上可見絲狀角膜上皮細胞異常增殖，由於絲狀組織與角膜上皮相連，通常需要將絲狀黏連物清除，局部再使用免疫抑制劑。治療通常通過環孢黴素A聯合使用眼表修復劑，或者鹼性成纖維細胞生長因子，促進角膜上皮細胞癒合。