繼發性高血壓和原發性高血壓危害一樣，因為血壓水平升高之後，會對靶器官造成不同的危害。舉例來說，比如眼睛，長期高血壓之後有可能造成眼底出血。另外最常見的部位是腦血管，長期高血壓之後會造成嚴重危害是腦出血，出血部位如果是在腦子裡邊比較重要的部位，患者可能很快出現腦疝或者死亡。長期的高血壓對心臟可以造成危害，比如高血壓性心臟病，可能會出現心律失常，像心房心顫等，時間長了之後心臟會擴大，心臟出現心力衰竭。長期的高血壓可以造成腎臟實質損害，可能會造成腎功能衰竭，最後需要透析，甚至最終危及到患者生命。因此，繼發性高血壓的危害很嚴重，對不同靶器官造成不同的損害。