病毒性肺炎的致病菌較多，不同致病菌導致的肺炎，治療方法不同。季節性流感病毒引起的肺炎，如甲型流感病毒和乙型流感病毒，可以選擇奧司他韋等藥物，治療效果較好，對於重症流感病毒性肺炎治療效果差。而腺病毒肺炎、呼吸道合胞病毒肺炎、EB病毒肺炎、巨細胞病毒性肺炎，可選擇相應抗病毒藥物，但治療效果較差。因此病毒性肺炎的治療效果、預後較細菌性肺炎差。