近4-5年丙肝治療迅速發展，之前治療丙肝方法為注射干擾素配合利巴韋林，目前以口服抗丙肝病毒藥物治療為主，稱為DNA藥物治療。主要針對丙肝基因組進行抗病毒藥物製作，主要包括NS3、NS4A、NS5A、NS5B等片段，涉及到的小分子化合物可直接針對病毒複製各環節進行干預與阻止從而清除病毒。

抗病毒藥物應用主要根據患者基因型進行選擇，若患者基因型不清時可選擇全基因型藥物，如索磷布韋、維帕他韋、奧比帕利、達塞布韋等。若明確患者基因型時可針對基因型進行選擇，若為1b型可選擇索磷布韋、維帕他韋或者格拉瑞韋等藥物。若基因為2a型時，選擇索磷布韋、維帕他韋等藥物效果較好。若給予患者合適療程時，可達到99%以上幾率將病毒徹底清除，即徹底治癒丙肝。