多數膽管癌患者術後都會出現復發，而且一般在2年左右是較關鍵的時間點。膽管癌的特點是復發往往在原位，較少出現向肺等其它位置的廣泛轉移。出現復發的膽管癌，二次手術的幾率較小，建議患者做詳細的影像學檢查評估，但是仍然是按照手術準備。比如復發腫瘤的位置、與肝門區重要的血管關係、是否侵犯血管，手術能否將其剝離乾淨，有沒有手術操作的空間。

如果可行，少數患者能進行二次手術切除，再次重建，多數患者已經沒有機會再做手術。這時建議患者通過經皮經肝穿刺將膽汁引流出，短時間恢復以後，通過通道看其能否放支架，將復發的狹窄位置撐開，然後再次恢復膽道輸送膽汁的功能，術後再建議患者化療、放療。