男性泌尿系統感染分為上尿路感染和下尿路感染，上尿路感染最常於急性腎盂腎炎，而下尿路感染最常於急性膀胱炎、急性尿道炎。對於泌尿系統感染，總的治療原則是抗菌、消炎。但由於上尿路感染和下尿路感染的發病特點不盡相同，因此用藥選擇和具體使用方法上不盡相同，主要治療如下：

一、抗感染治療：

1、上尿路感染：一般表現出明顯的全身症狀，如發熱等，同時有腰痛症狀，感染症狀較重。一般需靜脈應用抗菌素，可根據尿培養結果選擇敏感抗生素，也可經驗性應用半合成青黴素、第三代頭孢菌素、喹諾酮類抗菌素，以及氨基糖苷類抗菌素。用藥週期較長，一般是靜脈應用10-14天，在症狀完全控制後，應繼續口服藥物如喹諾酮類藥物治療2-4周；

2、下尿路感染：在急性膀胱炎時，一般推薦應用喹諾酮類口服藥物，如左氧氟沙星，用藥週期一般為7天。如果存在有梗阻性問題導致的急性膀胱炎，用藥週期應適當延長到14天，且應儘可能解決梗阻問題。而急性尿道炎最常見於淋球菌性尿道炎，一般推薦應用頭孢克肟、左氧氟沙星等藥物進行治療。另外，還有非淋菌性尿道炎，病原體為支原體或衣原體，主要用藥選擇是阿奇黴素、多西環素、左氧氟沙星。

二、一般治療：

除抗感染治療外，生活上應多飲水，形成較多尿液以沖洗尿道。還應暫停性生活、注意休息、避免勞累等，也可以應用緩解症狀的藥物。如果存在明顯尿頻、尿急症狀，可以應用黃酮哌酯類藥物改善症狀。