大部分肛瘻都是可以徹底治癒的。如果是複雜性的肛瘻，內口很多或者外口很多，治療起來可能比較麻煩，有可能治療以後會出現復發等情況。

肛瘻以單純的肛瘻為主，也就是有一個內口、一個外口，然後有一個瘻管將內口和外口連接起來。瘻管的質地比較硬，呈條索狀，內口的位置可以比較低，也可以很高。如果內口比較低，也就是低位的肛瘻，行一期切除或者瘻管切開就可以，如果是高位的肛瘻需要行掛線手術。如果患者的內口很多或者外口很多，也就是複雜性肛瘻，在手術之前需要做造影，要反覆的做幾次造影，明確瘻管的形態、走形。如果不能夠一次性解決問題，可能還要分次手術，也就是一次手術以後傷口癒合好了，可以再次住院、再次做手術。