對於肛瘻的患者，特別是高位複雜性肛瘻的患者，瞭解瘻管的走行方向以及尋找到內口是手術成敗的關鍵。所以給肛瘻的患者，特別是高位複雜性肛瘻的患者做核磁共振，可以幫助大夫瞭解肛瘻的瘻管走形，儘可能找到內口的位置，可以提高診斷水平和手術的治癒水平。

如果很精確的知道內口在哪，明確了瘻管的走向，手術一次性治癒的幾率就比較高，對解剖結構也瞭解。所以建議肛瘻的患者，特別是高位複雜性肛瘻的患者做核磁共振，在手術之前，對手術有很大幫助。